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全校不分系學士學位學程                    
師範學院 教育學系                  
文化資源與休閒產業學系                
體育學系                  
幼兒教育學系            
特殊教育學系                    
數位媒體與文教產業學系                
運動競技學士學位學程
自113學年度轉型為「競技與運動科學學系」
                       
人文學院 兒童文學研究所                        
人文學院南島文化研究博士班                            
公共與文化事務學系                  
英美語文學系                    
美術產業學系                    
音樂學系                      
華語文學系                    
身心整合與運動休閒產業學系                      
理工學院 理工學院應用科學與生物技術博士班                            
資訊管理學系              
資訊工程學系                      
應用數學系                      
應用科學系                    
生命科學系                      
綠色與資訊科技學士學位學程
自113學年度轉型為「綠能與資訊科技學系」
                       
綠能與資訊科技碩士學位學程                            
生物醫學碩士學位學程                            
高齡健康與照護管理原住民專班                            
高齡健康與照護管理二年制在職學位學程
(113學年度招生)
                           
大數據管理應用學士二年制在職學位學程                            
食品生物技術應用二年制在職學位學程