辦學指導原則
秉持我國大學法之精神—大學以研究學術，培育人才，提升文化，服務社會，促進國家發展為宗旨；並確實體認大學最重要的長期成員是學術精湛且不同領域的教授，而學校最重要的存在基礎與社會橋樑就是學生們。教授們在大學以學術自由為基礎，長期且持續性的探索、創造新的知識與文明；學生則以「做中學」的實踐，努力傳承老師們的學養並開啟創新而有勝於藍的準備。同時，大學所有的成果將會由教授與畢業生—都是大學培養的優質人才，源源不絕的，有效率的帶到社會，具體展現，造福人群。國立臺東大學以落實－培育專業知能與人文素養兼備的學生，協助教師發展專業，厚植學校學術實力，創新區域知識經濟，以及協助社會發展等為辦學使命。
學校治理原則
本諸追求學術卓越的理想與任重道遠的大學辦學使命，個人當適切尊重且平衡大學治理密切相關之「教育部的監督權」、「校長的行政權」、「教師的教育權」、及「學生的學習權」等，並在未來致力於保持這四權間良好互動關係，共同持續優化大學校園典章制度，以創造優勢的經營環境。個人深切了解—自由、民主是大學理想的人文精神，可是大學最終的目標是追求學術的卓越。個人並認同—民主的真諦是創造與包容！只有在一個鼓勵向上與求同存異的校園倫理與規範中，學術自由、校園民主與倫理才能夠發揮極致，以建立一個和諧、高效率、充滿學術氣氛的校園，進而追求更高水準的學術卓越，豐富人類社會的文化與文明。
辦學目標實踐
學生方面，基本要求是培養「自主學習、即時就業、終身學習、適性發展」之專業知能與人文素養兼備的畢業生；同時，勉勵畢業生懷抱「經世致用」的志向；讓國立臺東大學的學生走出校門的時候即是寶貴的社會資產。教師方面：基本上學校必須儘量提供資源協助教師力爭上游，發展專業；教師則必須在教學、研究、服務三大天職做妥當的落實，持續因應自我專長特色的發展，努力發揮；同時，本諸學者精神，持續就專長領域，精益求精。行政人員方面(包括校長)：秉持「服務」的工作理念；以專業來贏得尊敬；以主動、積極來提昇效率與效能；建立視工作為成就的人生觀。國立臺東大學漸次發展為優質精緻型「綠色國際大學」：教師們擁有卓越的教學與特色的研究，並以學術專長提供多元具體的服務，善盡社會責任；大學整體發展重點學術特色，成為支持綠色知識經濟產業發展的國際化大學。相信全校同仁們均同意：「國立臺東大學」大學整體，永遠是學生們、教授們、行政同仁們、以及校友們的人生夥伴；國立臺東大學的畢業生，以及師長們的學術成果，也永遠是社會的資產。